红河州科学技术院是红河州科学技术局下属正科级公益一类事业法人单位。于2019年6月12日，注册成立。同时，加挂红河州科技创新中心、红河州科技成果转移转化中心、红河州科技合作交流中心、红河州科技统计信息中心4块牌子。
红河州科学技术院主要承接红河州科技局业务工作，协助州科技局做好红河州科技创新政策的制定落实和科技创新体系建设；科技成果转移转化和促进产学研结合的有关政策落实；“双创”工作，打造“双创”升级版；科技对外交往、科技交流政策出台并推动落实，承担“科技入滇”专项工作，承担沪滇科技对口帮扶与合作等工作。承担全州火炬统计、科普统计和全社会研发经费投入等具体统计工作，对县市、企业进行业务培训。承担红河州科技宣传、信息等工作。承担科研项目受理、评审、立项、过程管理、验收等具体工作。承担推动全州生物医药产业发展和企业自主创新能力建设。承担红河州国家农业高新技术产业示范区创建申报和推进工作。承担全州科技成果评价工作。负责组织企业申报国家高新技术企业、云南省科技型中小企业，对申报企业进行指导和辅导。承担开展技术合同认定、技术市场交易等工作。
红河州科学技术院目前实有在职员工20人，其中：专业技术人员16人，管理人员1人，工勤人员3人。其中：副高级职称3人，中级职称9人，初级职称5人。
